Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc18a3O35304 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc18a3O35304 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc18a3O35304 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms