Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MttpO08601 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MttpO08601 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MttpO08601 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MttpO08601 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MttpO08601 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MttpO08601 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MttpO08601 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MttpO08601 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MttpO08601 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MttpO08601 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MttpO08601 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MttpO08601 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MttpO08601 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MttpO08601 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MttpO08601 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MttpO08601 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MttpO08601 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MttpO08601 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MttpO08601 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MttpO08601 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MttpO08601 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MttpO08601 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MttpO08601 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MttpO08601 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MttpO08601 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MttpO08601 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MttpO08601 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MttpO08601 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MttpO08601 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MttpO08601 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MttpO08601 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MttpO08601 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MttpO08601 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MttpO08601 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MttpO08601 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MttpO08601 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MttpO08601 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MttpO08601 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MttpO08601 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MttpO08601 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MttpO08601 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MttpO08601 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MttpO08601 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MttpO08601 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MttpO08601 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MttpO08601 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MttpO08601 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MttpO08601 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MttpO08601 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MttpO08601 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MttpO08601 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MttpO08601 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MttpO08601 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MttpO08601 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MttpO08601 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MttpO08601 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MttpO08601 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MttpO08601 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MttpO08601 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MttpO08601 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MttpO08601 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MttpO08601 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MttpO08601 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MttpO08601 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MttpO08601 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MttpO08601 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MttpO08601 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MttpO08601 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MttpO08601 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MttpO08601 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MttpO08601 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MttpO08601 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MttpO08601 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MttpO08601 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MttpO08601 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MttpO08601 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MttpO08601 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MttpO08601 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MttpO08601 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MttpO08601 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MttpO08601 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MttpO08601 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MttpO08601 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MttpO08601 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms