Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn2O08529 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn2O08529 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn2O08529 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn2O08529 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn2O08529 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn2O08529 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn2O08529 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn2O08529 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn2O08529 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn2O08529 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn2O08529 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn2O08529 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn2O08529 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn2O08529 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn2O08529 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms