Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Usp35M0QWN7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp35M0QWN7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp35M0QWN7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Usp35M0QWN7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Usp35M0QWN7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Usp35M0QWN7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Usp35M0QWN7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Usp35M0QWN7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Usp35M0QWN7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Usp35M0QWN7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Usp35M0QWN7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Usp35M0QWN7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp35M0QWN7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Usp35M0QWN7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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