Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ascl4M0QW46 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms