Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm8050L7N2E3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8050L7N2E3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms