Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp955bL7N232 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zfp955bL7N232 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms