Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3542K7N6U2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3542K7N6U2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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