Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20918J3QN17 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20918J3QN17 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms