Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gm6176J3QK59 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gm6176J3QK59 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gm6176J3QK59 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gm6176J3QK59 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gm6176J3QK59 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gm6176J3QK59 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gm6176J3QK59 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6176J3QK59 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Gm6176J3QK59 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm6176J3QK59 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6176J3QK59 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gm6176J3QK59 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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