Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21818J3KMS6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms