Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AK157302I3ITR1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AK157302I3ITR1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms