Protein–RNA interactions for Protein: H3BJG9

Ly6l, Lymphocyte antigen 6L, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6lH3BJG9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6lH3BJG9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms