Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tubgcp6G5E8P0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tubgcp6G5E8P0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tubgcp6G5E8P0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tubgcp6G5E8P0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tubgcp6G5E8P0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms