Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r12G5E8G1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r12G5E8G1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r12G5E8G1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.8 ms