Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r58G3X9U3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms