Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Arfgef1G3X9K3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arfgef1G3X9K3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms