Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r76F8VQ63 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r76F8VQ63 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms