Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms