Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dcdc2bF7BCK0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dcdc2bF7BCK0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dcdc2bF7BCK0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms