Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21970F6XX07 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms