Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10378F6XQQ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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Gm10378F6XQQ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm10378F6XQQ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10378F6XQQ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10378F6XQQ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10378F6XQQ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10378F6XQQ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10378F6XQQ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10378F6XQQ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10378F6XQQ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10378F6XQQ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10378F6XQQ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10378F6XQQ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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