Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm10563F6WIE4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Gm10563F6WIE4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm10563F6WIE4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms