Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cald1E9QA15 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cald1E9QA15 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cald1E9QA15 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms