Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q5

1700113H08Rik, RIKEN cDNA 1700113H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700113H08RikE9Q9Q5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700113H08RikE9Q9Q5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms