Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7E4

Gm8882, Predicted gene 8882, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8882E9Q7E4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8882E9Q7E4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8882E9Q7E4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8882E9Q7E4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8882E9Q7E4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8882E9Q7E4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8882E9Q7E4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8882E9Q7E4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8882E9Q7E4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8882E9Q7E4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8882E9Q7E4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm8882E9Q7E4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8882E9Q7E4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8882E9Q7E4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8882E9Q7E4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms