Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf11E9Q6E5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf11E9Q6E5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srsf11E9Q6E5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf11E9Q6E5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms