Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc85cE9Q6B2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms