Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtproE9Q612 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtproE9Q612 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms