Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd1E9Q3H4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Susd1E9Q3H4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms