Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tarbp1E9Q368 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tarbp1E9Q368 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tarbp1E9Q368 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms