Protein–RNA interactions for Protein: E9Q355

Catsperg1, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg1E9Q355 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Catsperg1E9Q355 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Catsperg1E9Q355 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms