Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt90E9Q1Z0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms