Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1L0

Vmn2r80, Vomeronasal 2, receptor 80, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r80E9Q1L0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn2r80E9Q1L0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn2r80E9Q1L0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn2r80E9Q1L0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn2r80E9Q1L0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn2r80E9Q1L0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn2r80E9Q1L0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn2r80E9Q1L0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms