Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms