Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcom1E9PZ54 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms