Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd1E9PZ26 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd1E9PZ26 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms