Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ift140E9PY46 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ift140E9PY46 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ift140E9PY46 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms