Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Abca16E9PWJ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abca16E9PWJ7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abca16E9PWJ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abca16E9PWJ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abca16E9PWJ7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abca16E9PWJ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abca16E9PWJ7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abca16E9PWJ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abca16E9PWJ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abca16E9PWJ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms