Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3543D3Z235 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3543D3Z235 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3543D3Z235 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3543D3Z235 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3543D3Z235 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3543D3Z235 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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