Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930467E23RikD3Z1P8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms