Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1500009C09RikD3YYW9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1500009C09RikD3YYW9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
1500009C09RikD3YYW9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1500009C09RikD3YYW9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500009C09RikD3YYW9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1500009C09RikD3YYW9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms