Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf217D3YYI7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms