Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kif28pD3YXS5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif28pD3YXS5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif28pD3YXS5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms