Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rfx8D3YU81 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx8D3YU81 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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