Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kpna7C0LLJ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna7C0LLJ0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna7C0LLJ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms