Protein–RNA interactions for Protein: B9EKX1

Ptchd4, Patched domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 904 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptchd4B9EKX1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ptchd4B9EKX1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd4B9EKX1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptchd4B9EKX1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptchd4B9EKX1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptchd4B9EKX1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptchd4B9EKX1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptchd4B9EKX1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptchd4B9EKX1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptchd4B9EKX1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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