Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf1bB9EJ57 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mterf1bB9EJ57 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms