Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Syce3B5KM66 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms