Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.3 ms